โรงเรียนวัดยางนอน สังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสุพรรณบุรี เขต 3 เป็นโรงเรียนขยายโอกาสทางการศึกษา เปิดทำการสอน ตั้งแต่ระดับชั้นอนุบาลปีที่ 1 ถึง ระดับชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3 ก่อตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 15 กันยายน พ.ศ. 2482 ใช้ชื่อว่า โรงเรียนประชาบาลตำบลเขาดิน (วัดยางนอน) ใช้ศาลาการเปรียญของวัดเป็นสถานที่เล่าเรียน เปิดทำการสอนตั้งแต่ ชั้นประถมศึกษาปีที่ 1 ถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 4 ใช้ประมวลการสอนของภาคการสอน 5 ตามหลักสูตรของกระทรวงศึกษาธิการ มีนายฉ่ำ รอดเรือง เป็นครูใหญ่คนแรก

รายชื่อผู้บริหารสถานศึกษาตั้งแต่เริ่มก่อตั้งโรงเรียนจนถึงปัจจุบัน 

1. นายฉ่ำ  รอดเรือง ดำรงตำแหน่ง พ.ศ.  2482  ถึง  พ.ศ.  2490 

2. นายถวัลย์  สุวรรณคงจันทร์ ดำรงตำแหน่ง พ.ศ.  2490  ถึง  พ.ศ.  2507 

3. นายสิริ  ชนะวงษ์ ดำรงตำแหน่ง พ.ศ.  2507  ถึง  พ.ศ.  2518

4. นายประสิทธิ์ ศรีคงอยู่ ดำรงตำแหน่ง พ.ศ.  2518  ถึง  พ.ศ.  2525

5. นายปลด  สกนธ์รวีนาท ดำรงตำแหน่ง พ.ศ.  2526  ถึง  พ.ศ.  2526

6. นายกุมุท  นิติสิริ ดำรงตำแหน่ง พ.ศ.  2527  ถึง  พ.ศ.  2530

7. นายสุนันท์  กมลฉ่ำ ดำรงตำแหน่ง พ.ศ.  2530  ถึง  พ.ศ.  2553

8. นายประเสริฐ  ชัยแย้ม ดำรงตำแหน่ง พ.ศ.  2553  ถึง  พ.ศ.  2564

9. นางสาวปิยาภรณ์  ภูฆัง ดำรงตำแหน่ง พ.ศ.  2564  จนถึงปัจจุบัน

ปัจจุบัน บริหารงานโดย นางสาวปิยภรณ์  ภูฆัง  มีข้าราชการครูและบุคลากรทางการศึกษา ทั้งหมด 19 คน เป็นข้าราชการครู 14 คน พนักงานราชการ 2 คน ลูกจ้าง 3 คน มีนักเรียนทั้งหมด 161 คน  เปิดทำการสอน ตั้งแต่ระดับชั้นอนุบาลปีที่ 1 ถึง ระดับชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3